Een baanbrekend onderzoek naar het microbioom van honden

Castillo-Fernandez J, Gilroy R, Jones RB, Honaker RW, Whittle MJ, Watson P, Amos GCA. Waltham catalogue for the canine gut microbiome: a complete taxonomic and functional catalogue of the canine gut microbiome through novel metagenomic based genome discovery. Microbioom. 2026;14(1):25. DOI: 10.1186/s40168-025-02265-w

Samenvatting

In januari 2026 publiceerden onderzoekers van het Waltham Petcare Science Institute de meest uitgebreide inventarisatie van het darmmicrobioom van honden ooit. Dit baanbrekende onderzoek vertegenwoordigt een paradigmaverschuiving in ons begrip van de gezonde spijsvertering bij honden, met de identificatie van 240 bacteriële kernsoorten die meer dan 80% van het gezonde darmmicrobioom van honden uitmaken, samen met de ontdekking van 89 geheel nieuwe soorten en 10 nieuwe bacteriële geslachten die uniek zijn voor honden.

De betekenis van het onderzoek gaat verder dan taxonomie. Door de functionele mogelijkheden van deze bacteriën in kaart te brengen, waaronder hun rol in de productie van korte-keten vetzuren, koolhydraatmetabolisme en galzuurtransformatie, legt dit onderzoek de wetenschappelijke basis voor een beter begrip van hoe voeding de gezondheid van het hele lichaam rechtstreeks beïnvloedt via het darmmicrobioom.

Belangrijkste bevindingen in een oogopslag

Metrisch	vinden
Steekproefgrootte	501 fecesmonsters van 107 honden (VS & Europa)
Kernsoorten	240 soorten die >80% van het darmmicrobioom uitmaken
Nieuwe ontdekkingen	982 nieuwe stammen, 89 nieuwe soorten, 10 nieuwe geslachten
Verbetering in kaart brengen	25% → 95% van metagenomische gelezen
Producenten van butyraat	37,5% van de soorten (45,6% in abundantie)
Producenten van propionaat	18,8% van de soorten
CAZyme Dichtheid	71 koolhydraatactieve enzymen per soort

Samenvatting van de studie: Methoden en ontwerp

Achtergrond en beweegredenen

Ondanks de toenemende belangstelling voor het microbioom onder wetenschappers en het grote publiek, is het onderzoek naar het darmmicrobioom van gezelschapsdieren opvallend beperkt gebleven. Voorafgaand aan dit onderzoek kon slechts ongeveer 25% van de metagenomische sequencingresultaten van honden in kaart worden gebracht met bekende genomen, waardoor een aanzienlijk deel van het darmmicrobioom van honden functioneel ongekarakteriseerd bleef.

Het onderzoeksteam merkte op dat, omdat er overlap is tussen sommige bacteriën in de darmen van mensen en honden, eerdere studies zich vaak richtten op overeenkomsten of verbanden met het menselijke microbioom in plaats van op de functionele rol van het microbioom van honden en hoe het specifiek betrekking heeft op de gezondheid van honden. Deze benadering, zo stelden de onderzoekers, beperkte inherent ons begrip van hondenspecifieke darmgezondheid.

Cohort en steekproefverzameling

In het onderzoek werden 501 fecesmonsters van 107 gezonde honden uit verschillende landen in de Verenigde Staten en Europa geanalyseerd. De honden waren afkomstig uit verschillende leefomgevingen, waaronder milieuverrijkte kennelfaciliteiten in het Waltham Petcare Science Institute en het Pet Health and Nutrition Center, maar ook uit de huizen van klanten van Mars Veterinary Health en medewerkers van Mars Petcare. Deze diversiteit was opzettelijk, om ervoor te zorgen dat de resulterende catalogus in grote lijnen representatief zou zijn voor de gezonde hondenpopulatie.

Sequencing en bioinformaticabenadering

De onderzoekers gebruikten zowel long-read als short-read shotgun metagenomische sequencing, de meest geavanceerde aanpak die momenteel beschikbaar is voor microbiome karakterisering. Deze methodologie met twee technieken maakte de reconstructie mogelijk van 5.753 metagenoom-geassembleerde genomen (MAG’s), die vervolgens werden gederepliceerd tot 1.031 verschillende bacteriestammen.

Het gebruik van metagenoom-geassembleerde genomen is vooral belangrijk omdat het onderzoekers in staat stelt om bijna volledige bacteriële genomen rechtstreeks uit omgevingsmonsters te reconstrueren, zonder dat hiervoor laboratoriumkweek nodig is. Deze aanpak legt de volledige diversiteit van het ecosysteem van de darmen vast, inclusief soorten die niet in laboratoriumomstandigheden kunnen worden gekweekt.

Taxonomische ontdekkingen: Een nieuwe kaart van de hondendarm

Schaal van nieuwe ontdekkingen

De omvang van de taxonomische ontdekkingen die met dit onderzoek zijn gedaan, is ongekend in het onderzoek naar gezelschapsdieren. Van de 1.031 geïdentificeerde stammen bleken er 982 nieuwe hondenspecifieke stammen te zijn die nog niet eerder beschreven waren in de wetenschappelijke literatuur. Belangrijker nog, de studie identificeerde 89 volledig nieuwe bacteriesoorten en 10 nieuwe bacteriële genera.

Deze nieuwe genera behoren tot bacteriële families waaronder Erysipelotrichaceae, Erysipelatoclostridiaceae, Atopobiaceae, Anaeroplasmataceae, Lachnospiraceae en Anaerovoracaceae. Van veel van deze families is bekend dat ze betrokken zijn bij vezelfermentatie en de productie van vetzuren met een korte keten, wat suggereert dat deze nieuw ontdekte organismen een belangrijke rol spelen bij de verwerking van voedingsstoffen.

De kern van het microbioom van de hond

Het onderzoek definieerde een kernmicrobioom van 240 bacteriesoorten die samen goed zijn voor meer dan 80% van de bacteriële inhoud in gezonde hondenfeces. Deze kern werd gevalideerd aan de hand van een onafhankelijke dataset van 47 honden, wat de robuustheid en generaliseerbaarheid van deze bevindingen bevestigde.

De meest voorkomende soort die werd geïdentificeerd was Prevotella copri, die 8,1% van het gemiddelde microbioom van de hond uitmaakte. Interessant genoeg is deze soort ook de meest voorkomende bacterie in het menselijke darmmicrobioom, hoewel de specifieke stammen en functionele rollen verschillen tussen gastheren. Andere zeer overvloedige kernsoorten waren Candidatus Skylacomonas (7,3%) en Candidatus Ileibacterium (5,7%), die beide nu erkend worden als belangrijke factoren die bijdragen aan de gezondheid van de darmen van honden.

Onderscheidend vermogen microbioom bij honden

Een belangrijke bevinding met diepgaande implicaties voor de voedingswetenschap is dat het microbioom van honden fundamenteel verschilt van het menselijke microbioom. De onderzoekers merkten op dat veel menselijke microbioomparadigma’s niet direct kunnen worden toegepast op honden.

Met name Akkermansia muciniphila, een bacteriesoort die enorme aandacht heeft gekregen in onderzoek naar de gezondheid van de darmen bij mensen vanwege zijn rol in de stofwisseling en de barrièrefunctie van de darm, was volledig afwezig in alle monsters van honden. Deze bevinding toont definitief aan dat honden hun eigen unieke darmecosysteem hebben ontwikkeld, met verschillende bacteriële populaties die zijn aangepast aan de fysiologie, het dieet en het immuunsysteem van honden.

VERBETERING VAN DE KAARTEN 25% → 95% Metagenomische gelezen nu toepasbaar op bekende hond-specifieke genomen

Functionele analyse: Wat het microbioom eigenlijk doet

De studie catalogiseerde niet alleen welke bacteriën er aanwezig waren, maar verschafte ook een ongekend inzicht in wat deze bacteriën eigenlijk doen. Deze functionele annotatie transformeert ons begrip van een loutere inventarisatie naar een mechanistisch raamwerk voor het begrijpen van darmgezondheid.

Productie van korteketenvetzuren

Vetzuren met een korte keten (SCFA’s), met name butyraat, propionaat en acetaat, zijn bacteriële gistingsproducten die in het hele lichaam dienst doen als signaalmoleculen en van invloed zijn op alles, van de integriteit van de darmbarrière tot de hersenfunctie, immuunregulatie en metabolische gezondheid.

Uit het onderzoek bleek dat 37,5% van de soorten genen bezit voor de productie van butyraat. Gewogen naar abundantie stijgt dit naar 45,6% van het microbioom, wat betekent dat bijna de helft van de bacteriële massa in een gezonde darm van een hond actief in staat is om deze kritische metaboliet te produceren. Nog eens 18,8% van de soorten kan propionaat produceren.

Butyraat is de primaire energiebron voor colonocyten (cellen die de dikke darm bekleden), houdt de integriteit van de darmbarrière in stand, vermindert ontstekingen en heeft aantoonbaar invloed op verre organen, waaronder de hersenen (via de darm-hersen-as), de lever (via de darm-lever-as) en het immuunsysteem (via de darm-immuun-as). De bevinding dat zo’n aanzienlijk deel van het microbioom van honden zich bezighoudt met de productie van butyraat, onderstreept het belang van het SCFA-metabolisme voor de gezondheid van honden.

Koolhydraatmetabolisme: Compensatie voor de beperkingen van honden

Een van de belangrijkste bevindingen van het onderzoek heeft betrekking op de koolhydraatstofwisseling. Honden hebben een beperkte genetische capaciteit voor het verteren van complexe koolhydraten in vergelijking met omnivoren en herbivoren. Uit het onderzoek blijkt dat het darmmicrobioom deze beperking in grote mate compenseert.

Soorten in het darmmicrobioom van honden bezitten gemiddeld 71 koolhydraatactieve enzymen (CAZymes) per soort. Deze enzymatische dichtheid maakt de afbraak mogelijk van diverse vezeltypes die honden niet zelfstandig kunnen verteren.

Afbreekcapaciteit koolhydraten

Type substraat	% van soorten die geschikt zijn
Chitine	75%
Hemicellulose	37%
Cellulose	36%
Zetmeel	22%

Deze bevinding heeft ingrijpende gevolgen voor voeding: de diversiteit aanvoedingsvezels ondersteunt direct de microbiële diversiteit en functie. Verschillende bacteriesoorten zijn gespecialiseerd in het afbreken van verschillende vezeltypes, wat betekent dat een gevarieerd vezelprofiel in de voeding een completer microbieel ecosysteem ondersteunt.

Galzuurmetabolisme: De darm-leververbinding

Een bijzonder belangrijke ontdekking was de identificatie van twee nieuwe Peptacetobacter-soorten die in staat zijn om primaire galzuren om te zetten in secundaire galzuren. De onderzoekers beschreven dit als “een belangrijke bevinding in de context van chronische GI-aandoeningen bij huisdieren”.

Deze bacteriën bezitten galzouthydrolase (BSH)-enzymen en het bai operon, de genetische machinerie die nodig is voor 7α-dehydroxylering, de kritieke stap in de synthese van secundaire galzuren. Secundaire galzuren, waaronder deoxycholzuur en lithocholzuur, hebben meerdere functies: ze beschermen tegen pathogene bacteriën, reguleren het levermetabolisme, beïnvloeden de glucosehomeostase en dienen als signaalmoleculen die verre organen beïnvloeden.

Deze bevinding belicht de darm-leveras op een mechanistisch niveau en toont aan dat specifieke darmbacteriën de leverfunctie rechtstreeks reguleren via galzuurmetabolisme.

Aminozuur biosynthese

Uit het onderzoek bleek dat 42% van de soorten complete lysinebiosynthesepaden bevatten, wat bijdraagt aan de beschikbaarheid van aminozuren voor de gastheer. Deze bevinding suggereert dat het microbioom een rol speelt in eiwitvoeding die verder gaat dan eenvoudige vertering, door actief aminozuren te synthetiseren die de gastheer kan gebruiken.

Veiligheidsprofiel van nieuwe soorten

Alle 89 nieuwe soorten die in het onderzoek werden geïdentificeerd, bleken commensale organismen te zijn zonder bekende virulentiefactoren. De onderzoekers merkten op dat de afwezigheid van pathobionten en pathogenen verwacht werd gezien het gezonde cohort, maar deze bevinding bevestigt niettemin dat de nieuw ontdekte soorten normale bewoners zijn van de gezonde darm van honden in plaats van opportunistische indringers.

Implicaties voor hondenvoeding

De auteurs van het onderzoek merkten expliciet op dat “dieetinterventies” veelbelovende resultaten laten zien in het moduleren van aspecten van de darmfunctie bij honden. De uitgebreide functionele karakterisering die dit onderzoek oplevert, bevestigt dat voeding een primaire hefboom is voor het ondersteunen van de darmgezondheid en, via de verbindingen van de darm met andere orgaansystemen, de gezondheid van het hele lichaam.

Voedingsvezels: Brandstof voor het microbioom

Met 71 koolhydraatactieve enzymen per soort en de capaciteit om cellulose, hemicellulose, zetmeel en chitine af te breken, is het darmmicrobioom van honden ontworpen om verschillende plantenvezels te verwerken. Het onderzoek valideert een benadering van hondenvoeding die prioriteit geeft aan prebiotische vezeldiversiteit om nuttige bacteriepopulaties te voeden.

Verschillende vezeltypes ondersteunen verschillende bacteriepopulaties, wat betekent dat voedingsdiversiteit zich direct vertaalt naar microbiële diversiteit. Een dieet dat rijk is aan gevarieerde plantaardige ingrediënten levert de substraten die nodig zijn voor een compleet, goed functionerend ecosysteem van de darmen.

SCFA-productie en gezondheid van het hele lichaam

De bevinding dat bijna de helft van het microbioom in overvloed butyraat produceert, positioneert de SCFA-productie als een centrale metriek van darmgezondheid. Dieetinterventies die de SCFA-producerende bacteriën ondersteunen, voornamelijk door het aanbieden van fermenteerbare vezels, hebben cascade-effecten in het hele lichaam.

Butyraat beïnvloedt de darm-hersenas (die stemming, cognitie en stressrespons beïnvloedt), de darm-immuunas (die ontstekingsreacties reguleert), de darm-leveras (die het levermetabolisme moduleert) en de darm-huidas (die de gezondheid van de huid beïnvloedt). Propionaat reguleert gluconeogenese en eetlust, terwijl acetaat dient als substraat voor lipogenese en energieproductie.

De argumenten voor hondenspecifieke formulering

Misschien wel de belangrijkste voedingsimplicatie van dit onderzoek is de definitieve demonstratie dat menselijke microbioomparadigma’s niet direct kunnen worden toegepast op honden. De volledige afwezigheid van Akkermansia muciniphila, ondanks haar prominente rol in onderzoek naar de gezondheid van de darmen bij mensen, is hier een goed voorbeeld van.

Deze bevinding pleit sterk voor hondenspecifieke nutritionele formulering gebaseerd op hondenspecifiek onderzoek, in plaats van extrapolatie van humane studies. De Waltham-catalogus biedt nu de wetenschappelijke basis voor precies deze aanpak.

Validatie van de Bonza ‘One Gut. Hele hond. Positionering

De bevindingen van de Waltham-catalogus vormen een overtuigende wetenschappelijke bevestiging van de kernpositionering van Bonza: “Eén darm. Hele hond.” In dit gedeelte wordt onderzocht hoe de ontdekkingen van het onderzoek elk element van dit raamwerk onderbouwen.

De darm als commandocentrum: Wetenschappelijke bevestiging

Het onderzoek toont aan dat het darmmicrobioom niet slechts een spijsverteringsorgaan is, maar een metabool en signaleringscentrum met invloed in het hele lichaam. De functionele annotatie onthult bacteriën die:

Korte-keten vetzuren die dienen als signaalmoleculen die de hersenfunctie (darm-hersenas), immuunregulatie (darm-immuunas), levermetabolisme (darm-leveras) en ontstekingsstatus in het hele lichaam beïnvloeden.

Secundaire galzuren via de nieuw ontdekte Peptacetobacter-soorten, die de leverfunctie en het glucosemetabolisme rechtstreeks reguleren.

Aminozuren via volledige biosynthesewegen, die bijdragen aan de eiwitvoeding en celfunctie.

Dit is precies wat “One Gut. Whole Dog.” beweert: dat gezondheid van de darmen de basis is waarop gezondheid van het hele lichaam is gebouwd.

Darm-orgaanassen: Nu in kaart gebracht op soortniveau

De educatieve inhoud van Bonza legt al lang de nadruk op de assen darm-hersenen, darm-immuunsysteem, darm-lever, darm-huid en darm-gewrichten. De Waltham-catalogus levert nu bewijs op soortniveau voor deze verbanden:

As	Waltham catalogus bewijsmateriaal
Darm-Brein	45,6% overvloed gewijd aan butyraatproductie; butyraat passeert bloed-hersenbarrière, moduleert neuroinflammatie
Darm-Lever	Nieuwe Peptacetobacter-soorten met BSH-enzymen en bai operon voor galzuurmetabolisme
Darm-immuun	SCFA-productie ondersteunt regulatoire T-celontwikkeling en ontstekingsmodulatie
Darm-huid	Ontstekingsremmende effecten van SCFA breiden zich uit naar huidweefsel via systemische circulatie
Darm-gewricht	De ontstekingsremmende eigenschappen van butyraat beïnvloeden de systemische ontstekingsstatus die van invloed is op de gezondheid van de gewrichten

Voeding als primaire hefboom: Bevestigd

De expliciete verklaring in het onderzoek dat “dieetinterventies” “veelbelovende resultaten laten zien in het moduleren van aspecten van de darmfunctie bij honden” valideert direct Bonza’s premisse dat voeding het primaire middel is om de darmgezondheid te ondersteunen.

De uitgebreide koolhydraatverwerkingscapaciteit van het microbioom (71 CAZymes per soort, met capaciteiten voor cellulose, hemicellulose, zetmeel en chitine) toont aan dat plantaardige vezels precies zijn wat het darmmicrobioom van honden kan verwerken. Deze bevinding ondersteunt Bonza’s formuleringsfilosofie om diverse prebiotische vezels te leveren via plantaardige ingrediënten.

Hondenspecifieke wetenschap: De Stichting

Bonza heeft consequent het belang van specifiek onderzoek bij honden benadrukt in plaats van alleen te vertrouwen op extrapolatie van onderzoeken bij mensen. De Waltham-catalogus valideert deze benadering krachtig door aan te tonen:

1. Het microbioom van honden verschilt fundamenteel van het menselijke microbioom: er zijn meer dan 900 voor honden specifieke stammen geïdentificeerd.

2. Belangrijke soorten die een prominente rol spelen in het onderzoek naar de gezondheid van de darmen van de mens (met name Akkermansia muciniphila) ontbreken volledig bij de hond.

3. Honden hebben hun eigen unieke ecosysteem van de darmen ontwikkeld, wat een hondenspecifieke aanpak van voeding en gezondheid vereist.

Dit is precies de wetenschappelijke basis waarop Bonza’s formuleringen zijn gebouwd.

Conclusie: Een nieuw tijdperk in de darmwetenschap bij honden

De Waltham-catalogus vormt een keerpunt in de wetenschap van het microbioom van honden. Door het in kaart brengen van het darmmicrobioom van honden tot nu toe het meest uitgebreid te maken, 240 kernsoorten en 89 nieuwe soorten te identificeren en hun functionele mogelijkheden ongekend gedetailleerd te karakteriseren, legt dit onderzoek de wetenschappelijke basis voor een evidence-based benadering van de gezondheid van de darmen van honden.

Voor Bonza dient dit onderzoek als onafhankelijke, collegiaal getoetste bevestiging van onze kernpositionering. De wetenschap bevestigt:

De darm is inderdaad een commandocentrum voor de gezondheid van het hele lichaam, waarbij bacteriële metabolieten via meerdere darm-orgaanassen invloed uitoefenen op verre organen.

Voeding is de belangrijkste hefboom om de darmfunctie te moduleren, waarbij de diversiteit aan voedingsvezels de microbiële diversiteit en functie direct ondersteunt.

Kattenspecifieke wetenschap is belangrijk, omdat het microbioom van honden fundamenteel verschilt van dat van mensen.

Eén darm. Hele hond. is geen marketingslogan, het is een wetenschappelijke realiteit, nu in kaart gebracht op soortniveau door ’s werelds toonaangevende onderzoeksinstituut op het gebied van voeding voor huisdieren.

“De taxa en functies die hier worden gepresenteerd geven het hoogste resolutiebeeld van het gezonde microbioom van huishonden tot nu toe.” – Castillo-Fernandez et al., Microbiome 2026