
Microbiome intestinal – Impacts sur les principaux aspects de la santé des chiens
Résumé
Le microbiome intestinal est un écosystème complexe et dynamique qui joue un rôle important dans la santé et le bien-être des chiens. Cette communauté complexe de micro-organismes influence divers systèmes corporels, du tractus gastro-intestinal au cerveau, au cœur et au système immunitaire. La compréhension de l’impact du microbiome sur la santé a ouvert de nouvelles voies pour le traitement et la prévention des maladies chroniques chez les chiens. Cet article explore les liens profonds entre le microbiome intestinal et différents aspects de la santé canine, en mettant en évidence les résultats des recherches actuelles et les stratégies thérapeutiques potentielles.
Table des matières
Le rôle du microbiome intestinal dans la santé systémique
- Aperçu du microbiome intestinal
- Influence sur le bien-être général
Influence du microbiome sur la santé gastro-intestinale
- Diarrhée et dysbiose microbienne
- Dysrégulation des acides biliaires
- Impact des antibiotiques
- Traitements ciblés sur le microbiote
Influence du microbiome intestinal sur la santé comportementale
- Axe intestin-cerveau et implications comportementales
- Influence microbienne sur l’agression et la phobie
- Impact sur la mémoire et les fonctions cognitives
- Interventions ciblées sur le microbiome pour les problèmes de comportement
Influence du microbiome intestinal sur la santé cardiovasculaire
- Rôle des métabolites microbiens dans les maladies cardiaques
- N-Oxyde de triméthylamine (TMAO) et maladie myxomateuse de la valve mitrale (MMVD)
- Acides gras à chaîne courte (AGCC) et fonction cardiaque
Influence du microbiome intestinal sur la santé immunitaire
- Interaction entre le microbiome intestinal et le système immunitaire
- Maladies inflammatoires de l’intestin (MII) et dysrégulation immunitaire
- Probiotiques et modulation immunitaire
- Réponses immunitaires induites par le stress
- Résumé des résultats
- Orientations futures et besoins en matière de recherche
Introduction
Ces dernières années, le lien entre l’homme et son compagnon canin s’est resserré, l’animal de compagnie devenant un membre à part entière du foyer. Cette évolution a également conduit à mettre davantage l’accent sur la santé des animaux de compagnie, d’autant plus que les chiens sont aujourd’hui atteints d’un grand nombre des mêmes maladies chroniques que leurs maîtres humains. Le microbiome intestinal, une communauté complexe de micro-organismes résidant dans le tractus gastro-intestinal, est au premier plan de cette recherche en raison de son impact significatif sur divers aspects de la santé.
Le microbiome intestinal n’est pas seulement un acteur clé de la digestion, il influence également toute une série de processus physiologiques, notamment la fonction immunitaire, le comportement et la santé cardiovasculaire. L’équilibre des espèces microbiennes dans l’intestin est crucial pour le maintien de la santé, et les perturbations de cet équilibre – appelées dysbiose – sontliées à de nombreuses maladies chroniques. Cet article explore en profondeur le rôle du microbiome intestinal dans la santé canine, en examinant son influence sur les systèmes gastro-intestinal, comportemental, cardiovasculaire et immunitaire.
Le rôle du microbiome intestinal dans la santé systémique
Aperçu du microbiome intestinal
Le microbiome intestinal est un écosystème diversifié et dynamique composé de bactéries, de virus, de champignons et d’autres micro-organismes qui habitent le tractus gastro-intestinal. Ces micro-organismes jouent un rôle essentiel dans le maintien de la santé en facilitant la digestion, en synthétisant les nutriments essentiels et en protégeant contre les agents pathogènes nocifs. La composition du microbiome intestinal est influencée par divers facteurs, notamment l’alimentation, l’âge, la génétique et les expositions environnementales.
Chez les chiens, comme chez les humains, le microbiome intestinal est très individualisé, ce qui signifie qu’il n’y a pas deux chiens qui ont exactement la même composition microbienne. Ce caractère unique est façonné par une combinaison de facteurs tels que le régime alimentaire, la prise de médicaments et même l’environnement dans lequel le chien vit. Un se caractérise généralement par un niveau élevé de diversité, qui permet de résister aux perturbations et de maintenir un écosystème équilibré dans l’intestin.
Influence sur le bien-être général
L’influence du microbiome intestinal s’étend au-delà du tractus gastro-intestinal, affectant de multiples aspects de la santé globale. Un microbiome diversifié et équilibré soutient les fonctions métaboliques, régule les réponses immunitaires et communique même avec le cerveau par l’intermédiaire de l’axe intestin-cerveau. La dysbiose, ou déséquilibre du microbiome, peut entraîner divers problèmes de santé, notamment des troubles gastro-intestinaux, une inflammation systémique et des changements de comportement.
Des recherches ont montré que les chiens dont le microbiome intestinal est plus diversifié sont généralement en meilleure santé et plus résistants aux maladies. À l’inverse, un microbiome moins diversifié est souvent associé à un risque accru de maladies chroniques, telles que les maladies inflammatoires de l ‘intestin (MII) et les affections cardiovasculaires. Il est essentiel de comprendre les relations complexes entre le microbiome intestinal et la santé globale pour développer des thérapies ciblées capables de restaurer ou de maintenir l’équilibre microbien.

Influence du microbiome sur la santé gastro-intestinale
Diarrhée et dysbiose microbienne
La diarrhée est l’un des motifs les plus fréquents de consultation vétérinaire chez les chiens, et elle est souvent liée à une dysbiose. Le microbiome intestinal joue un rôle crucial dans le maintien de la santé gastro-intestinale, et les perturbations de cet équilibre peuvent entraîner des diarrhées et d’autres problèmes digestifs. Plusieurs facteurs peuvent contribuer à la dysbiose, notamment les infections, les changements de régime alimentaire et l’utilisation d’antibiotiques.
La présence de certaines espèces bactériennes, telles que Clostridium difficilea été fortement associée à une diarrhée sévère chez les chiens. Ce pathogène peut proliférer dans l’intestin, en particulier lorsque l’équilibre du est perturbé, ce qui entraîne une détresse gastro-intestinale importante. En revanche, des bactéries bénéfiques comme Clostridium hiranonis jouent un rôle protecteur en convertissant les acides biliaires primaires en acides biliaires secondaires, qui sont essentiels à la santé intestinale. Lorsque les niveaux de ces bactéries bénéfiques sont réduits, cela peut conduire à une dysrégulation des acides biliaires, contribuant à la diarrhée.

Dysrégulation des acides biliaires
Les acides biliaires sont essentiels à la digestion et à l’absorption des graisses, et leur métabolisme est fortement influencé par le microbiome intestinal. Chez les chiens, les acides biliaires sont produits par le foie puis modifiés par les bactéries intestinales en acides biliaires secondaires. Ces acides biliaires secondaires jouent un rôle dans la régulation de la motilité intestinale et le maintien de l’intégrité de la muqueuse intestinale.
En cas de dysbiose, la production et le métabolisme des acides biliaires peuvent être déréglés. Par exemple, chez les chiens atteints d’entéropathie chronique (une affection similaire aux MICI chez l’homme), on observe souvent une diminution de l’abondance des bactéries métabolisant les acides biliaires, telles que Clostridium hiranonis. Cette réduction entraîne un déséquilibre dans le métabolisme des acides biliaires, ce qui peut exacerber les symptômes gastro-intestinaux tels que la diarrhée. Des stratégies thérapeutiques visant à rétablir l’équilibre des bactéries métabolisant les acides biliaires sont à l’étude en tant que traitements potentiels d’affections telles que l’entéropathie chronique.
Impact des antibiotiques
Les antibiotiques sont couramment prescrits pour traiter les infections bactériennes chez les chiens, mais leur impact sur le microbiome intestinal peut être profond. Si les antibiotiques peuvent sauver des vies, ils perturbent également l’équilibre du microbiome intestinal, entraînant une réduction des bactéries bénéfiques et permettant aux espèces pathogènes de proliférer. Cette perturbation peut entraîner des symptômes gastro-intestinaux associés aux antibiotiques (SGAA), tels que diarrhée, vomissements et anorexie.
Des études ont montré que l’utilisation d’antibiotiques peut modifier de manière significative le microbiome intestinal, avec des effets qui peuvent persister longtemps après la fin du traitement. Par exemple, une étude a montré que les chiens traités avec l’antibiotique tylosine présentaient des niveaux élevés d’acides biliaires primaires pendant les deux mois suivant le traitement, ce qui indique une perturbation à long terme du métabolisme des acides biliaires. En outre, il a été démontré que les antibiotiques réduisent l’abondance de Clostridium hiranonis, un acteur clé du maintien de l’équilibre des acides biliaires, ce qui exacerbe encore les symptômes gastro-intestinaux.
Compte tenu de ces risques, il est important d’utiliser les antibiotiques de manière judicieuse et d’envisager des traitements alternatifs qui soutiennent le microbiome, tels que les probiotiques ou la transplantation de microbiote fécal (FMT).
Traitements ciblés sur le microbiote
Le rôle du microbiome intestinal dans la santé étant de mieux en mieux compris, de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant le microbiome voient le jour. Il s’agit notamment des probiotiques, des prébiotiques, des synbiotiques et de la transplantation de microbiote fécal (FMT). Les probiotiques sont des micro-organismes vivants qui peuvent avoir des effets bénéfiques sur la santé en rétablissant l’équilibre du microbiome intestinal, tandis que les prébiotiques sont des fibres alimentaires qui nourrissent les bactéries bénéfiques. Les synbiotiques combinent à la fois les probiotiques et les prébiotiques pour renforcer leurs effets.
La FMT est une approche plus directe, impliquant le transfert du microbiote fécal d’un donneur sain à un receveur atteint de dysbiose. Cette procédure s’est révélée prometteuse dans le traitement de maladies telles que la diarrhée chronique et les infections à Clostridium difficile chez l’homme et le chien. Bien qu’encore expérimentale, la FMT représente une avancée potentielle dans les thérapies ciblées sur le microbiome.
Influence du microbiome intestinal sur la santé comportementale
Axe intestin-cerveau et implications comportementales
L’axe intestin-cerveau est une voie de communication bidirectionnelle entre l’intestin et le cerveau, médiée par le système nerveux, les hormones et le système immunitaire. Ce lien joue un rôle important dans la régulation de l’humeur, du comportement et des fonctions cognitives chez les chiens. Des recherches récentes ont montré que le microbiome intestinal peut influencer le cerveau et le comportement par la production de neurotransmetteurs, la modulation du système immunitaire et l’interaction avec le système nerveux central.
Par exemple, certaines bactéries intestinales sont impliquées dans la production d’acide gamma-aminobutyrique (GABA), un neurotransmetteur inhibiteur qui aide à réguler les réactions d’anxiété et de stress. Les perturbations du microbiome intestinal peuvent modifier les niveaux de ces neurotransmetteurs, ce qui peut entraîner des changements comportementaux tels qu’une augmentation de l’anxiété, de l’agressivité ou de la dépression.
Influence microbienne sur l’agression et la phobie
Les problèmes comportementaux tels que l’agression et les phobies sont fréquents chez les chiens et peuvent être difficiles à gérer. La recherche suggère que le microbiome intestinal pourrait jouer un rôle dans ces comportements en influençant la production d’hormones et de neurotransmetteurs. Par exemple, des études ont montré que les chiens phobiques présentaient des taux plus élevés d’espèces de Lactobacillus, connues pour produire du GABA et moduler la fonction immunitaire. D’autre part, on a constaté que les chiens agressifs présentaient des niveaux plus élevés de Turicibacter qui réagissent à la sérotonine, un neurotransmetteur.
Ces résultats indiquent que des déséquilibres dans le microbiome intestinal pourraient contribuer à des problèmes de comportement. Cependant, la relation entre des espèces microbiennes spécifiques et le comportement est complexe, avec des résultats contradictoires rapportés dans différentes études. Cela souligne la nécessité de poursuivre les recherches pour comprendre les mécanismes par lesquels le microbiome influence le comportement et pour mettre au point des interventions efficaces.
Impact sur la mémoire et les fonctions cognitives
La mémoire et les fonctions cognitives sont essentielles pour que les chiens apprennent, s’adaptent et interagissent avec leur environnement. De nouvelles recherches suggèrent que le microbiome intestinal peut influencer les fonctions cognitives par son impact sur la santé du cerveau. Par exemple, on a constaté que les chiens ayant de moins bonnes performances lors des tests de mémoire présentaient des niveaux plus élevés d’actinobactéries, un phylum de bactéries associé à des conditions neurodégénératives chez l’homme.
Bien que les mécanismes exacts ne soient pas encore totalement compris, on pense que les métabolites microbiens produits dans l’intestin peuvent influencer les fonctions cérébrales et les processus cognitifs. Ces résultats ouvrent la possibilité d’utiliser des thérapies ciblées sur les microbiomes pour soutenir la santé cognitive des chiens, en particulier lorsqu’ils vieillissent.
Interventions ciblées sur le microbiome pour les problèmes de comportement
Compte tenu des preuves croissantes de l’influence de l’axe intestin-cerveau sur le comportement, les chercheurs explorent les interventions ciblées sur le microbiome comme moyen de traiter les problèmes de comportement chez les chiens. Les probiotiques, les prébiotiques et les synbiotiques sont étudiés pour leur capacité à améliorer le comportement en modulant le microbiome intestinal.
Par exemple, il a été démontré que certaines souches probiotiques réduisent l’anxiété et le stress chez les chiens, potentiellement en augmentant la production de GABA ou en réduisant l’inflammation. De même, les interventions alimentaires qui favorisent un microbiome intestinal sain peuvent contribuer à atténuer les problèmes comportementaux liés à l’agressivité, à l’anxiété et au déclin cognitif.
Influence du microbiome intestinal sur la santé cardiovasculaire
Rôle des métabolites microbiens dans les maladies cardiaques
Les maladies cardiovasculaires, telles que la valvulopathie mitrale myxomateuse (MMVD), sont l’une des principales causes de morbidité et de mortalité chez les chiens, en particulier lorsqu’ils vieillissent. Des recherches récentes ont mis en évidence le rôle des métabolites microbiens dans le développement et la progression des maladies cardiaques. Ces métabolites, produits par le microbiome intestinal, peuvent influencer divers aspects de la santé cardiovasculaire, notamment le métabolisme énergétique et l’inflammation.
Par exemple, le N-oxyde de triméthylamine (TMAO), un métabolite issu du métabolisme microbien de composés alimentaires tels que la carnitine et la choline, a été associé à la gravité de la MMVD chez les chiens. Des niveaux élevés de TMAO sont associés à un risque accru de maladie cardiaque, ce qui en fait une cible potentielle pour des interventions thérapeutiques.
N-Oxyde de triméthylamine (TMAO) et maladie myxomateuse de la valve mitrale (MMVD)
Le TMAO est un sous-produit du métabolisme microbien des composés azotés présents dans les aliments tels que la viande, les produits laitiers, le poisson et les œufs. Une fois produit dans l’intestin, le TMAO passe dans la circulation sanguine, où il a été démontré qu’il contribuait à la progression des maladies cardiovasculaires, y compris le MMVD.
Chez les chiens atteints de MMVD, des taux élevés de TMAO sont associés à une progression plus sévère de la maladie. La recherche suggère que la réduction de l’apport en précurseurs du TMAO, tels que la carnitine et la choline, pourrait aider à gérer la maladie en limitant la production de ce métabolite nocif. En outre, cibler le microbiome intestinal pour réduire l’abondance des bactéries productrices de TMA, comme Escherichia coli, est une autre stratégie potentielle pour atténuer l’impact du TMAO sur la santé cardiaque.
Acides gras à chaîne courte (AGCC) et fonction cardiaque
Les acides gras à chaîne courte (AGCC) sont des métabolites bénéfiques produits par la fermentation des fibres alimentaires par les bactéries intestinales. Les acides gras saturés jouent un rôle crucial dans la régulation du métabolisme énergétique, la réduction de l’inflammation et le soutien de la santé cardiovasculaire globale. Chez les chiens atteints de MMVD, on a observé des taux plus faibles de bactéries productrices de SCFA, ce qui peut contribuer à la progression de la maladie.
Bien que le rôle exact des acides gras saturés dans la santé cardiaque soit encore à l’étude, l’augmentation de l’abondance des bactéries productrices d’acides gras saturés par le biais d’interventions diététiques pourrait constituer une approche thérapeutique potentielle pour la prise en charge de la MMVD. Pour ce faire, il convient de promouvoir une alimentation riche en fibres, qui favorise la croissance des bactéries intestinales bénéfiques produisant des acides gras saturés.
Influence du microbiome intestinal sur la santé immunitaire
Interaction entre le microbiome intestinal et le système immunitaire
Le microbiome intestinal joue un rôle clé dans la régulation du système immunitaire, influençant à la fois l’immunité intestinale locale et les réponses immunitaires systémiques. Le système immunitaire surveille en permanence l’environnement intestinal, faisant la distinction entre les bactéries commensales inoffensives et les agents pathogènes potentiels. La dysbiose peut perturber cet équilibre, entraînant un dérèglement immunitaire et le développement d’affections inflammatoires chroniques telles que les maladies inflammatoires de l’intestin (MII).
Chez le chien, les MICI se caractérisent par une inflammation chronique du tractus gastro-intestinal, souvent associée à une réponse immunitaire hyperactive contre les microbes intestinaux. Cette maladie est liée à des altérations significatives du microbiome intestinal, avec une réduction des bactéries bénéfiques et une augmentation des espèces pathogènes. Le rétablissement de l’équilibre du microbiome intestinal par des interventions diététiques, des probiotiques ou d’autres thérapies est étudié comme moyen de gérer les MICI et d’autres maladies liées à l’immunité.
Maladies inflammatoires de l’intestin (MII) et dysrégulation immunitaire
Les MICI sont des maladies complexes et multifactorielles qui touchent aussi bien les humains que les chiens. Chez les chiens, les MICI se caractérisent souvent par des diarrhées chroniques, des vomissements, une perte de poids et des douleurs abdominales. La cause exacte des MICI n’est pas entièrement comprise, mais on pense qu’elle implique une interaction entre la prédisposition génétique, les facteurs environnementaux et la dysbiose.
Les chiens atteints de MICI présentent généralement une réponse immunitaire hyperactive aux microbes intestinaux, ce qui entraîne une inflammation chronique et des lésions tissulaires. Cette dysrégulation immunitaire s’accompagne souvent de changements importants dans le microbiome intestinal, notamment une diminution des bactéries bénéfiques et une augmentation des espèces nuisibles. Les probiotiques, les prébiotiques et les interventions diététiques qui favorisent un microbiome équilibré sont étudiés en tant que traitements potentiels des MICI, dans le but de réduire l’inflammation et de restaurer la santé de l’intestin.
Probiotiques et modulation immunitaire
Les probiotiques se sont révélés prometteurs pour moduler le système immunitaire et réduire l’inflammation chez les chiens atteints de MICI. Certaines souches de probiotiques peuvent favoriser la production de composés anti-inflammatoires et soutenir une réponse immunitaire saine. Par exemple, il a été démontré que le probiotique multi-souches Slab51 avait des effets anti-inflammatoires chez les chiens atteints de MICI, potentiellement en favorisant la croissance des bactéries bénéfiques et en réduisant l’abondance des espèces nocives.
Outre les probiotiques vivants, les postbiotiques -extraits de la paroi cellulairedes bactéries probiotiques – ont également démontré des propriétés immunomodulatrices. Des études ont montré que les postbiotiques peuvent réduire la production de cytokines pro-inflammatoires et favoriser la santé intestinale, ce qui en fait une option thérapeutique potentielle pour la prise en charge des MICI et d’autres affections inflammatoires.
Réponses immunitaires induites par le stress
Le stress est un facteur commun de dérèglement immunitaire et peut exacerber des maladies telles que les MICI. Par exemple, il a été démontré que le stress lié au transport chez les chats induit des symptômes semblables à ceux des MICI, notamment la diarrhée, l’activation immunitaire et l’augmentation de la perméabilité intestinale. Cette dysbiose induite par le stress peut entraîner une prolifération de microbes pro-inflammatoires, ce qui aggrave encore l’inflammation intestinale.
Les peptides antimicrobiens (AMP) apparaissent comme un traitement potentiel de l’inflammation intestinale induite par le stress. Les AMP peuvent réduire l’abondance des microbes pro-inflammatoires tout en favorisant la croissance d’espèces bénéfiques qui produisent des acides gras à chaîne courte (AGCC) et ont des effets anti-inflammatoires. Cette approche est prometteuse pour la gestion des problèmes intestinaux liés au stress chez les chiens et les chats.
Conclusion
Le microbiome intestinal joue un rôle essentiel dans la modulation de divers aspects de la santé canine, de la santé gastro-intestinale et comportementale aux fonctions cardiovasculaires et immunitaires. Cet article explore les interactions complexes entre le microbiome intestinal et ces différents systèmes, soulignant le potentiel des thérapies ciblées sur le microbiome pour prévenir et traiter les maladies chroniques chez les chiens.
Bien que notre compréhension de l’influence du microbiome intestinal sur la santé soit encore en évolution, les recherches présentées ici soulignent l’importance de maintenir un microbiome équilibré et diversifié. Les recherches futures devraient se concentrer sur la personnalisation de ces interventions afin de tenir compte des différences individuelles dans le microbiome et d’explorer leur applicabilité à différentes espèces. Au fur et à mesure que nos connaissances progressent, le microbiome intestinal pourrait devenir un élément central de la prévention et du traitement des maladies chroniques chez les chiens, offrant ainsi un nouvel espoir d’améliorer leur santé et leur bien-être.
Tableau 1 : Aperçu du rôle du microbiome intestinal dans la santé canine
| Espèces | Maladie/Symptôme | Cause sous-jacente | Microbes impliqués | Thérapie potentielle | Résultats et considérations |
|---|---|---|---|---|---|
| Chien | Diarrhée | Pathogènes intestinaux | Escherichia-Shigella, Salmonella, Clostridium perfringens et autres, en nombre plus élevé | Antibiotiques | Peut réduire les bactéries commensales saines et exacerber les symptômes, et ne doit donc être utilisé qu’en cas de nécessité médicale. |
| Chien | Symptômes gastro-intestinaux associés aux antibiotiques | Diminution du microbiote commensal, « dysbiose ». | Probiotiques ou synbiotiques multi-souches | Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer les dosages et les formulations efficaces. | |
| Chien | Dérèglement des acides biliaires | Clostridium hiranonis ou Peptacetobacter hiranonis inférieur | Améliorer la conversion microbienne des acides biliaires primaires en acides biliaires secondaires | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. Peut être induit par un traitement antibiotique. | |
| Chien | Infection à Clostridium difficile | C. difficile | Transplantation de microbiote fécal | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. Peut être induit par l’utilisation chronique d’antibiotiques. | |
| Chien | Maladie inflammatoire de l’intestin et entéropathie chronique – diarrhée | Inflammation de l’intestin | Mal compris | Modulation des micro-organismes transformant les acides biliaires | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. Les maladies inflammatoires de l’intestin sont complexes et multifactorielles, impliquant une variété de microbes. |
| Chien | Agressivité, comportement phobique | Déséquilibres hormonaux et neurotransmetteurs | Haute teneur en Lactobacillus (chiens phobiques) | Mal compris | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. Les déficiences comportementales sont complexes et impliquent une variété de microbes. |
| Chien | Perte de mémoire | Neurodégénérescence | Élevé Actinobactéries | Mal compris | Les actinobactéries constituent un vaste phylum de bactéries, ce qui rend difficile la compréhension des processus métaboliques qui guident l’association. |
| Chien | Dépression, neuroinflammation | Augmentation prolongée du taux de cortisol | Élevé Escherichia-Shigella | Prévenir les changements rapides de régime alimentaire | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. Peut être déclenché par des changements alimentaires brusques et drastiques. Le cortisol n’est pas toujours pro-inflammatoire. |
| Chien | Maladie myxomateuse de la valve mitrale | Dérèglement du métabolisme énergétique | Escherichia coli | Réduire la carnitine, la phosphatidylcholine, la bétaïne et la l-carnitine alimentaires, ce qui réduit la production microbienne de TMA. | Ces composés azotés sont présents en grande quantité dans la viande, les produits laitiers, le poisson et les œufs. La limitation de la production microbienne de TMA réduit le risque et la progression de la MMVD. |
| Chien | Maladie inflammatoire de l’intestin-inflammation | Immunoglobulines | Diminution du microbiote commensal, « dysbiose ». | Probiotiques | Les probiotiques ont un potentiel anti-inflammatoire chez les chiens atteints de MICI. |
| Chat | Diarrhée | Pathogènes intestinaux | Escherichia-Shigella, Salmonella, Clostridium perfringens et autres, en nombre plus élevé | Antibiotiques | Peut réduire les bactéries commensales saines et exacerber les symptômes, et ne doit donc être utilisé qu’en cas de nécessité médicale. |
| Chat | Dérèglement des acides biliaires | Clostridium hiranonis ou Peptacetobacter hiranonis inférieur | Améliorer la conversion microbienne des acides biliaires primaires en acides biliaires secondaires | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. Peut être induit par un traitement antibiotique. | |
| Chat | Infection à Clostridium difficile | C. difficile | Transplantation de microbiote fécal | La FMT chez les animaux de compagnie doit faire l’objet de recherches plus approfondies. Peut être induit par l’utilisation chronique d’antibiotiques. | |
| Chat | Maladie inflammatoire de l’intestin et entéropathie chronique – diarrhée | Inflammation de l’intestin | Mal compris | Mal compris | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. |
| Chat | MMVD | TMAO, SBA et SCFA | Mal compris | Mal compris | Des recherches supplémentaires sont nécessaires. |
| Chat | Stress lié au transport | Inflammation gastro-intestinale | Nombre élevé de microbes pro-inflammatoires(Bacteroidetes, Proteobacteria) | Administration de peptides antimicrobiens (AMP) | Réduit certains microbes pro-inflammatoires tout en favorisant la croissance des microbes producteurs de SCFA et anti-inflammatoires(Eisenbergiella, Blautia). |
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